Auf einem geheimen Navy-Forschungsschiffs wird eine Leiche gefunden. Durch ihre Ermittlungen stoßen sie auf ein weiteres Schiff und auf einen gefährlichen Virus der hoch ansteckend ist und das ganze NCIS Team in Gefahr bringt. Jenny versucht derweil alles um Aufklärung zu bekommen, doch die Geheimhaltung stellt sie vor immer neue Hindernisse...